18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0880 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0880  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 69 aa  124  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  46.77 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0511  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  57.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 73 aa  40  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>