26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0511 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0511  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
87 aa  166  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0880  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.56 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  56.45 
 
 
73 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  56.67 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  51.67 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  51.61 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  65.91 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  58.33 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  49.09 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.21 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  58.33 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  43.94 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.64 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  36.36 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  34.33 
 
 
76 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>