175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4016 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  95.6 
 
 
91 aa  170  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  87.91 
 
 
91 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  86.81 
 
 
91 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  84.62 
 
 
91 aa  156  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  83.52 
 
 
91 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  81.32 
 
 
91 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  75.29 
 
 
88 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  75.29 
 
 
88 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  66.23 
 
 
107 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  73.21 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  64.94 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  67.86 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  52.05 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  54.79 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  52.05 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  52.05 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  52.05 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  66.07 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  45.68 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  61.02 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  52.11 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  49.35 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  65.38 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  42.67 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  39.29 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  57.63 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  57.63 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  53.03 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  42.47 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  39.02 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  52.78 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  52.78 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  52.78 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  57.14 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  53.33 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  45.21 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  45.95 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  52.54 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  58.7 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  58.7 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
82 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  43.66 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  43.66 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  40.51 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  56.36 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  50 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.08 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  46.67 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 
321 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  39.44 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  37.33 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  47.14 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>