81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2593 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 74 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  85.14 
 
 		 74 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  74.36 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  74.36 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  80.77 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  82.46 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  77.94 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  63.01 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.09 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60.32 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.27 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.91 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.91 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.4 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.4 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  59.65 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  59.38 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  61.54 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  63.46 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  62.96 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  57.38 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  57.38 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.82 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  57.38 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.45 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  38.24 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  57.35 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  40 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  35.14 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  34.85 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.6 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  36.76 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  36.23 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 91 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 93 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  47.5 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  36.07 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  35.29 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  37.14 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  36.76 
 
 		 321 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 91 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  35.94 
 
 		 88 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  37.74 
 
 		 88 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 75 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>