47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1619 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 
222 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 
222 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  100 
 
 
222 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  99.1 
 
 
222 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  93.24 
 
 
223 aa  353  1e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  53.54 
 
 
232 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.64 
 
 
606 aa  167  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1613  V-type ATP synthase subunit K  40.69 
 
 
164 aa  88.6  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.932181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1894  V-type ATP synthase subunit K  40.69 
 
 
164 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1690  V-type ATP synthase subunit K  35.14 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0252  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.06 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2263  V-type ATP synthase subunit K  39.57 
 
 
155 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3076  V-type ATP synthase subunit K  42.74 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1807  v-type ATPase, subunit K  37.24 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1505  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.4 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1554  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.4 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0854  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.5 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2368  V-type ATP synthase subunit K  37.67 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  28.39 
 
 
321 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1218  hypothetical protein  51.56 
 
 
83 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000000000445422  normal  0.214233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1179  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50.77 
 
 
85 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00560744  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2681  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.84 
 
 
93 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0243152  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0283  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  43.08 
 
 
82 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.319058  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0578  V-type ATP synthase subunit K  35.25 
 
 
141 aa  52.8  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.45725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1679  V-type ATP synthase subunit K  35.82 
 
 
140 aa  51.6  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000026282  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1613  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.91 
 
 
85 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1239  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  55.56 
 
 
79 aa  48.9  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0419  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.57 
 
 
70 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0378  A1AO H+ ATPase subunit K  44.83 
 
 
81 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0390  A1AO H+ ATPase subunit K  44.83 
 
 
81 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2568  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.08 
 
 
71 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0859386  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2897  V-type ATP synthase subunit K  31.15 
 
 
149 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00696895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1433  A-type ATP synthase subunit K  49.18 
 
 
68 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3223  V-type ATP synthase subunit K  31.15 
 
 
149 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1763  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.23 
 
 
76 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2672  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.62 
 
 
71 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2767  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.62 
 
 
71 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000764187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1198  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.62 
 
 
71 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0357317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2349  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.54 
 
 
82 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.211164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1105  H+transporting two-sector ATPase C subunit  35.94 
 
 
142 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  35.38 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
111 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0520  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.06 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  32.43 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13768  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  25.32 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.518766  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.5 
 
 
102 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 
74 aa  41.6  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>