140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1265 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 74 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  76.92 
 
 		 69 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  67.16 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  69.7 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  57.97 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.88 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  53.73 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  69.7 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  69.7 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  55.38 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.23 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.18 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.62 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  42.19 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  40.91 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.94 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.21 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  49.06 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.55 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.16 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  45.16 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  45.16 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  45.16 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  47.92 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 75 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  45.45 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  45.83 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2749  F0F1 ATP synthase subunit C  45.16 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000357567  normal  0.274405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.1 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  39.66 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  39.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  39.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.94 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  37.7 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  38.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.92 
 
 		 78 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3757  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00912084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>