62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  100 
 
 		 67 aa  126  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  71.64 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68.66 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.66 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68.66 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  55.22 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  58.46 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  55.22 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.22 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  67.16 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  53.73 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50.77 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.44 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  49.23 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.28 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.42 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  38.81 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  35.48 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  51.11 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.76 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  36.84 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  41.3 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  36.84 
 
 		 321 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29600  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.62 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  48.28 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  38.6 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1303  H+transporting two-sector ATPase C subunit  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0722272  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  40  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  31.58 
 
 		 77 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.26 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>