108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1666 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  100 
 
 
77 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  84.21 
 
 
74 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
81 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  63.16 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  59.46 
 
 
73 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  55.84 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.49 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  55.56 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  57.75 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  58.11 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  60.29 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  50.67 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  48.68 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  79.17 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.33 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.33 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  51.39 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.05 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 
81 aa  66.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  55.71 
 
 
71 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  61.33 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.57 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.06 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  57.69 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  54.17 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  58.7 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  55.77 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  55.77 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.56 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
72 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  66.13 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  46.77 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
78 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 
83 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  40 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  51.43 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.17 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  55.32 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  55.32 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  36.11 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  40 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.86 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.27 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  42.55 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 
75 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 
75 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.08 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.08 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>