64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0143 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 77 aa  148  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  58.57 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.22 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  52.31 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  48.57 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  46.97 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  43.66 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.88 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.1 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.1 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  33.87 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  35.48 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.93 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1303  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0722272  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  28.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.27 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  36.84 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2387  ATP synthase F0, C subunit  55.88 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  41.07 
 
 		 76 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  44.19 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  33.93 
 
 		 92 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  38.64 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  37.31 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  38.78 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  32.08 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  35.59 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>