171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2387 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2387  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 72 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  52.17 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  53.97 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  53.97 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  52.38 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  52.38 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  52.38 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  52.38 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  52.31 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  60.78 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  60.78 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  57.41 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  52.31 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  40.3 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  37.31 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50.79 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 321 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  50 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  49.06 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  39.68 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  38.57 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  41.54 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  51.11 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  51.11 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  37.5 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 		 82 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  38.1 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  48.15 
 
 		 76 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  34.92 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  45.9 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>