19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1303 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1303  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0722272  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.43 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  38.71 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 76 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  34.38 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  34.92 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.5 
 
 		 74 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  44.19 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.22 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  37.04 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  44.19 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>