55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1300 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 
104 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  46.97 
 
 
78 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
321 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  47.92 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.77 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  47.62 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  48.89 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  33.77 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  40.32 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  44.9 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  39.68 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  44.9 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.84 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  39.68 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  39.58 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  40.86 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  39.58 
 
 
81 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>