More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6401 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 337 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.25 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  57.53 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2450  alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  46.44 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  45.03 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  44.72 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.17 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  42.11 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.23 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  45.16 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.69 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.51 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.75 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.65 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  43.85 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  46.9 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.78 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  43.87 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  47 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.06 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  43.6 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  41.69 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.36 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 326 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  43 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.38 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.87 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  44.48 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  48.33 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  43 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.04 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  41.93 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.78 
 
 		 324 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.77 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.39 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.46 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.51 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  40.79 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.18 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  41.93 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.13 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.72 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1046  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0321902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  38.37 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  41.75 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.51 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  40.56 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  40.45 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  39.34 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  41.82 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.6 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.27 
 
 		 327 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.42 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.37 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  44.93 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.73 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.63 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.08 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.75 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.28 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>