More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2063 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2063  transport system permease protein  100 
 
 
339 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2700  transport system permease protein  65.18 
 
 
344 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3297  transport system permease protein  60.98 
 
 
341 aa  326  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  57.1 
 
 
336 aa  322  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.61 
 
 
351 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4511  transport system permease protein  44.9 
 
 
349 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  42.16 
 
 
363 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  36.84 
 
 
322 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  40.38 
 
 
347 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  36.84 
 
 
322 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.19 
 
 
334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  39.37 
 
 
348 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  38.94 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  38.98 
 
 
350 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  40.13 
 
 
341 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  39.87 
 
 
347 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  41.21 
 
 
352 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  35.44 
 
 
350 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  35.71 
 
 
340 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 
334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  46.02 
 
 
353 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
334 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  35.39 
 
 
340 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  35.39 
 
 
340 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  39.37 
 
 
344 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  35.39 
 
 
334 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.25 
 
 
334 aa  185  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  36.07 
 
 
347 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
334 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  35.05 
 
 
340 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  42.61 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  36.58 
 
 
335 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35.5 
 
 
333 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  45.71 
 
 
335 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  39.86 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.45 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  38.83 
 
 
344 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  40.13 
 
 
343 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  43 
 
 
332 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  40.98 
 
 
363 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  38.33 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  36.98 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  41.72 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  35.2 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  36.22 
 
 
329 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  36.18 
 
 
337 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  43.11 
 
 
325 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  43.94 
 
 
354 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  33.84 
 
 
351 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  40.68 
 
 
347 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  36.39 
 
 
357 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
351 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
351 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
351 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.1 
 
 
335 aa  169  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  33.84 
 
 
351 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  33.84 
 
 
351 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
351 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
351 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  40.91 
 
 
366 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  35.06 
 
 
334 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  42.43 
 
 
360 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  39.45 
 
 
333 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  35.06 
 
 
334 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  34.38 
 
 
336 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  35.58 
 
 
340 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  41.48 
 
 
366 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  38.96 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  41.48 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  41.52 
 
 
332 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  37.79 
 
 
333 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  40.49 
 
 
335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  36.67 
 
 
336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  33.23 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  36.31 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.29 
 
 
346 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  41.78 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.78 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  41.78 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.78 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  41.01 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.78 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  41.78 
 
 
334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  40.98 
 
 
338 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  38.83 
 
 
351 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.45 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.45 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.45 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  34.98 
 
 
326 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  39.87 
 
 
366 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  35 
 
 
338 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  36.34 
 
 
336 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.22 
 
 
337 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
366 aa  159  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  39.26 
 
 
340 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  30.6 
 
 
338 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>