65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3488 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  52.74 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  50.85 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  50.43 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  52.17 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  52.17 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  52.36 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
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NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  48.93 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  48.94 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  51.78 
 
 		 757 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.53 
 
 		 755 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  48.53 
 
 		 755 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  44.5 
 
 		 765 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.21 
 
 		 754 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  52.84 
 
 		 761 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  48.4 
 
 		 753 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  50.27 
 
 		 771 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
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NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  50.57 
 
 		 744 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  63.64 
 
 		 131 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
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NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  35.91 
 
 		 786 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.96 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
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NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  29.36 
 
 		 828 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.45 
 
 		 1039 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.58 
 
 		 1053 aa  65.1  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
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NC_013525  Tter_0049  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.27 
 
 		 811 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.5 
 
 		 1416 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0251  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.53 
 
 		 1010 aa  58.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_2091  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  27.62 
 
 		 983 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.102414  normal  1 
 
 
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NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.11 
 
 		 1042 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  27.14 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
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NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  24.77 
 
 		 832 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
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NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.18 
 
 		 1056 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.35 
 
 		 742 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2874  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.57 
 
 		 747 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0422  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.85 
 
 		 813 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.02 
 
 		 770 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.68 
 
 		 1065 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0431  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.36 
 
 		 811 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_0149  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  30.06 
 
 		 752 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  27.68 
 
 		 745 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28 
 
 		 749 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0667  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.62 
 
 		 1226 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606243 
 
 
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NC_008609  Ppro_2498  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.65 
 
 		 744 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184259  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1833  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.84 
 
 		 781 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2767  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  21.83 
 
 		 820 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705593  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  52.63 
 
 		 1014 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1360  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  22.65 
 
 		 957 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202167  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.33 
 
 		 851 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4588  ribonucleoside reductase  26.86 
 
 		 1189 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  27.88 
 
 		 858 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
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NC_009718  Fnod_0421  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.07 
 
 		 841 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0345  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.83 
 
 		 761 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00309044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0018  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.9 
 
 		 781 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132839  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.45 
 
 		 1184 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0324  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.83 
 
 		 866 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000374976  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2318  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.55 
 
 		 745 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_3117  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  23.16 
 
 		 744 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_0267  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.78 
 
 		 1153 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.249441  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_286  ribonucleotide reductase  27.93 
 
 		 761 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000168014  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4943  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.94 
 
 		 861 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0906221  normal  0.0926375 
 
 
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NC_002950  PG1129  ribonucleotide reductase  33.01 
 
 		 850 aa  42  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1871  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.09 
 
 		 743 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289901  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  25.36 
 
 		 881 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1201  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.97 
 
 		 744 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0301379  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_3073  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.09 
 
 		 744 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000012314 
 
 
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