40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6297 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  99.56 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  79.65 
 
 		 227 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  63.44 
 
 		 229 aa  297  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  64.1 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  58.7 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  59.75 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  55.07 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  53.88 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  53 
 
 		 757 aa  201  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  49.54 
 
 		 765 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  48.61 
 
 		 755 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.61 
 
 		 755 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.53 
 
 		 754 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  47.91 
 
 		 753 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  50 
 
 		 761 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.06 
 
 		 771 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.62 
 
 		 744 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  57.63 
 
 		 131 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  35.83 
 
 		 786 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.12 
 
 		 1053 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.13 
 
 		 1039 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  29.46 
 
 		 828 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.02 
 
 		 1416 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.81 
 
 		 1042 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.12 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  29.03 
 
 		 862 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.69 
 
 		 1056 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  27.78 
 
 		 832 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.65 
 
 		 745 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.18 
 
 		 742 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.39 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0149  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.87 
 
 		 752 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  27.32 
 
 		 770 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3117  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.39 
 
 		 744 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0053  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.17 
 
 		 794 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.91 
 
 		 749 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0018  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.42 
 
 		 781 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  38 
 
 		 1014 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.59 
 
 		 851 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>