45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1084 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  59.23 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  57.83 
 
 		 229 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  57.39 
 
 		 229 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  56.41 
 
 		 234 aa  281  8.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  54.74 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  55.27 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  55.13 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  50.43 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  45.81 
 
 		 765 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  41.15 
 
 		 755 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  41.15 
 
 		 755 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  43.36 
 
 		 757 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  45.18 
 
 		 753 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  45.41 
 
 		 754 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  45.5 
 
 		 761 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.37 
 
 		 771 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.39 
 
 		 744 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  58.97 
 
 		 131 aa  141  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  34.55 
 
 		 786 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.37 
 
 		 1416 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  26.98 
 
 		 828 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.63 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.55 
 
 		 1053 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.4 
 
 		 1039 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  27.27 
 
 		 862 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.95 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2401  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.5 
 
 		 795 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0986621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3117  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  24.23 
 
 		 744 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  23.44 
 
 		 742 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.98 
 
 		 851 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  23.32 
 
 		 770 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.36 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  22.5 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  27.88 
 
 		 858 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  25.13 
 
 		 832 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0053  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.33 
 
 		 794 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0216352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2091  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  26.72 
 
 		 983 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.102414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.23 
 
 		 749 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0049  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.23 
 
 		 811 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1833  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  23.95 
 
 		 781 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4943  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.86 
 
 		 861 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0906221  normal  0.0926375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  29.28 
 
 		 881 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1704  putative ribonucleotide reductase  28.06 
 
 		 861 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0251  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.79 
 
 		 1010 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>