46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1470 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  81.62 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  68 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  59.23 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  67.5 
 
 		 229 aa  287  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  59.05 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  59.83 
 
 		 227 aa  281  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  58.4 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  52.36 
 
 		 216 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  47.47 
 
 		 765 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  46.85 
 
 		 757 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  46.73 
 
 		 755 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  46.73 
 
 		 755 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  46.05 
 
 		 754 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  46.5 
 
 		 753 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  50 
 
 		 761 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  45 
 
 		 771 aa  175  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.89 
 
 		 744 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  60.68 
 
 		 131 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  34.74 
 
 		 786 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  29.81 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.96 
 
 		 1053 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.45 
 
 		 1039 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.12 
 
 		 1416 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  26.85 
 
 		 862 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.12 
 
 		 1042 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.53 
 
 		 1065 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.99 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.22 
 
 		 1056 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  26.79 
 
 		 832 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0251  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.7 
 
 		 1010 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  29.54 
 
 		 881 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.99 
 
 		 851 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4943  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.38 
 
 		 861 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0906221  normal  0.0926375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2767  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  22.27 
 
 		 820 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.75 
 
 		 1014 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25 
 
 		 770 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2032  ribonucleotide reductase, coenzyme B12-dependent  27.92 
 
 		 871 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0530454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0964  ribonucleotide reductase large subunit  22.51 
 
 		 964 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.0000000000000224803  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  28.83 
 
 		 858 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1704  putative ribonucleotide reductase  25.71 
 
 		 861 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0606  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.63 
 
 		 833 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  24.35 
 
 		 742 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0741  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.92 
 
 		 844 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0649  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.92 
 
 		 844 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2091  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  30.88 
 
 		 983 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.102414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>