45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1269 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  59.48 
 
 		 229 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
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NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  56.36 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  55.07 
 
 		 229 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  55.07 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  55.23 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  55.13 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  51.3 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  49.79 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  44.13 
 
 		 765 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
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NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  44.81 
 
 		 757 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
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NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.97 
 
 		 771 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
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NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  44.79 
 
 		 761 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  41.26 
 
 		 754 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  43.18 
 
 		 755 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.18 
 
 		 755 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  45.55 
 
 		 753 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.39 
 
 		 744 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  45.93 
 
 		 131 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
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NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  34.33 
 
 		 786 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.12 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
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NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.92 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.21 
 
 		 1042 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.2 
 
 		 1053 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
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NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  27.44 
 
 		 862 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
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NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  24.88 
 
 		 828 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
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NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.77 
 
 		 1416 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.62 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0964  ribonucleotide reductase large subunit  24.38 
 
 		 964 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.0000000000000224803  normal  0.61869 
 
 
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NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.64 
 
 		 749 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.46 
 
 		 742 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_0431  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.14 
 
 		 811 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0422  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.29 
 
 		 813 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0251  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.74 
 
 		 1010 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_0049  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  22.01 
 
 		 811 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  28.57 
 
 		 858 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
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NC_008786  Veis_5007  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.78 
 
 		 813 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009012  Cthe_0053  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  29.53 
 
 		 794 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0216352  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.04 
 
 		 1184 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
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NC_002950  PG1129  ribonucleotide reductase  30.36 
 
 		 850 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_2091  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  24.34 
 
 		 983 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.102414  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0667  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.33 
 
 		 1226 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606243 
 
 
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NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  25.1 
 
 		 881 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  21.82 
 
 		 832 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
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NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.87 
 
 		 1065 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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