50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0257 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.55 
 
 		 851 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  48.44 
 
 		 862 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1704  putative ribonucleotide reductase  49.57 
 
 		 861 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4943  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.35 
 
 		 861 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0906221  normal  0.0926375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  47.83 
 
 		 881 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  48.39 
 
 		 828 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0649  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.86 
 
 		 844 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0741  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.86 
 
 		 844 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2032  ribonucleotide reductase, coenzyme B12-dependent  47.86 
 
 		 871 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0530454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  47.49 
 
 		 832 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0667  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.1 
 
 		 1226 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4588  ribonucleoside reductase  47.85 
 
 		 1189 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0422  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.12 
 
 		 813 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0431  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.14 
 
 		 811 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1115  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  46.89 
 
 		 840 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.8 
 
 		 1184 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5007  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.29 
 
 		 813 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  40.81 
 
 		 858 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  30.04 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  29.96 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  30.29 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  32.58 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  27.94 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  29.12 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  29.12 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.55 
 
 		 755 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  27.55 
 
 		 755 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  27.04 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  28.43 
 
 		 765 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  32.1 
 
 		 761 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  29.35 
 
 		 757 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  32.08 
 
 		 771 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  26.99 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  29.63 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.02 
 
 		 754 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  31.34 
 
 		 749 aa  52  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.4 
 
 		 744 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22200  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.4 
 
 		 766 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0053  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.57 
 
 		 794 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0216352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1137  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.75 
 
 		 765 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2401  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  27.11 
 
 		 795 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0986621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0821  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  27.54 
 
 		 770 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.547254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_286  ribonucleotide reductase  26.76 
 
 		 761 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000168014  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1970  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.62 
 
 		 1180 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.23883  decreased coverage  0.000751585 
 
 
-
 
NC_002936  DET0345  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.76 
 
 		 761 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00309044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.27 
 
 		 1014 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.57 
 
 		 1039 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0049  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.26 
 
 		 811 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2543  ribonucleoside reductase precursor  27.61 
 
 		 1317 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>