43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  99.56 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  79.2 
 
 		 227 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  63 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  63.68 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  58.26 
 
 		 232 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  59.32 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  55.07 
 
 		 229 aa  271  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  53.88 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  53 
 
 		 757 aa  201  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  50 
 
 		 765 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  49.07 
 
 		 755 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.07 
 
 		 755 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.53 
 
 		 754 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  48.37 
 
 		 753 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  50 
 
 		 761 aa  177  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.06 
 
 		 771 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.62 
 
 		 744 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  57.63 
 
 		 131 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  35.83 
 
 		 786 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.52 
 
 		 1053 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.61 
 
 		 1039 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  29.46 
 
 		 828 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.24 
 
 		 1042 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.02 
 
 		 1416 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.12 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  29.03 
 
 		 862 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.69 
 
 		 1056 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  27.78 
 
 		 832 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  28.65 
 
 		 745 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.18 
 
 		 742 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.39 
 
 		 1065 aa  48.5  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0149  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.87 
 
 		 752 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  27.32 
 
 		 770 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0053  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.17 
 
 		 794 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.68 
 
 		 749 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3117  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  24.87 
 
 		 744 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0018  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  26.89 
 
 		 781 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  38 
 
 		 1014 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.59 
 
 		 851 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0422  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.56 
 
 		 813 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3539  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  44.44 
 
 		 850 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0421  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.55 
 
 		 841 aa  41.6  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>