48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0458 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1470  hypothetical protein  81.62 
 
 		 229 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.113816 
 
 
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NC_007947  Mfla_2542  hypothetical protein  58.4 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.158289  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_00800  hypothetical protein  60.68 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_6297  hypothetical protein  67.16 
 
 		 229 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72520  hypothetical protein  66.67 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_1084  ribonucleotide reductase, alpha subunit  56.41 
 
 		 232 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1269  hypothetical protein  56.36 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_3488  hypothetical protein  50.85 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2949  putative Vitamin B12-dependent ribonucleotide reductase  46.26 
 
 		 765 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00955068 
 
 
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NC_007494  RSP_3547  ribonucleotide reductase  46.36 
 
 		 755 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3230  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  46.36 
 
 		 755 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0951  ribonucleotide reductase large subunit  44.64 
 
 		 757 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.13792 
 
 
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NC_009484  Acry_0185  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  49.47 
 
 		 761 aa  184  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87733  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_0951  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  46.05 
 
 		 754 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3514  hypothetical protein  46.5 
 
 		 753 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.489826  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_1591  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  47.47 
 
 		 771 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784862 
 
 
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NC_010338  Caul_3858  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  48.42 
 
 		 744 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_2085  hypothetical protein  60.68 
 
 		 131 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481295 
 
 
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NC_007643  Rru_A3258  ribonucleotide reductase large subunit  34.9 
 
 		 786 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1766  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  30.13 
 
 		 1053 aa  71.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.12495  normal  0.408298 
 
 
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NC_013158  Huta_1290  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.38 
 
 		 1039 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A2113  ribonucleotide reductase large subunit  28.85 
 
 		 828 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325185  n/a   
 
 
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NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.82 
 
 		 1416 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1886  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.21 
 
 		 1065 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0257  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.08 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.636631  normal  0.522668 
 
 
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NC_008826  Mpe_B0385  putative ribonucleotide reductase protein  26.98 
 
 		 862 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.633147 
 
 
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NC_012029  Hlac_2375  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.41 
 
 		 1056 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013743  Htur_2137  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  29.3 
 
 		 1042 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1936  ribonucleotide reductase system  29.19 
 
 		 881 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0251  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.43 
 
 		 1010 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_2130  ribonucleotide reductase large subunit  26.15 
 
 		 832 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964032  normal  0.427551 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4943  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.54 
 
 		 861 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0906221  normal  0.0926375 
 
 
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NC_014212  Mesil_1317  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  25.51 
 
 		 1014 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.163268  normal  0.295376 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0741  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.57 
 
 		 844 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0649  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.57 
 
 		 844 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2032  ribonucleotide reductase, coenzyme B12-dependent  28.57 
 
 		 871 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0530454  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0006  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  25.51 
 
 		 742 aa  46.2  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1360  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.04 
 
 		 957 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202167  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5497  ribonucleotide reductase large subunit  27.85 
 
 		 858 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199014  normal  0.653858 
 
 
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NC_010623  Bphy_3305  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.11 
 
 		 851 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725004  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_0964  ribonucleotide reductase large subunit  20.42 
 
 		 964 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.0000000000000224803  normal  0.61869 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1704  putative ribonucleotide reductase  25 
 
 		 861 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118151  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_2031  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  24.51 
 
 		 770 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3539  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  43.24 
 
 		 850 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1383  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.98 
 
 		 749 aa  42.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_3117  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha  22.68 
 
 		 744 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2091  ribonucleoside-diphosphate reductase adenosylcobalamin-dependent  30.14 
 
 		 983 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.102414  normal  1 
 
 
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