93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3366 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3366  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 359 aa  729    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03838  ABC transporter substrate binding protein  28.93 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2999  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.62 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000215349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.33 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  25.83 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  26.16 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  27.72 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  27.06 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  26.12 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.78 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  23.53 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  24.57 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  25.17 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  26.36 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.06 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.03 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.82 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  25.33 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  25.5 
 
 		 640 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.75 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25.28 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  24.04 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  25.94 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  22.59 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  24.92 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  26.16 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  23.96 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.16 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  24.92 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  26.09 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  26.52 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  23.81 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  23.86 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  24.25 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.42 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  25.25 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  24.66 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.24 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  24.43 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  26.37 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  26.9 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  26.6 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  25.95 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  24.25 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  23.84 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  23.62 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  24 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  25.57 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  23.66 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  23.16 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  25.99 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  25.27 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.51 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  24.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  30.12 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  25.26 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.32 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  24.26 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.46 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  23.36 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  25.38 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.98 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  26.96 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  24.01 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  23.95 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  27.46 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  23.84 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  24.63 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  24.06 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  32.61 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.57 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  23.37 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.18 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  23.27 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  22.36 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  22.18 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.91 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  22.97 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  21.68 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  28 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  24.01 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  25.44 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.2 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>