71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3053 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
446 aa  922    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
446 aa  922    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 
453 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  42.6 
 
 
467 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  42.26 
 
 
469 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  42.38 
 
 
467 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  43.69 
 
 
457 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  43.46 
 
 
457 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  43.43 
 
 
457 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  43.43 
 
 
457 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  43.46 
 
 
457 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  43.46 
 
 
457 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  43.46 
 
 
457 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  43.22 
 
 
457 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  43.22 
 
 
457 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  43.22 
 
 
457 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  43.43 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  43.43 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  43 
 
 
411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2011  hypothetical protein  81.6 
 
 
183 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.271694  normal  0.217697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  43.77 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  51.32 
 
 
190 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  25.53 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  25.53 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  23.81 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  24.18 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  24.18 
 
 
482 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  24.03 
 
 
482 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  24.03 
 
 
482 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  24.03 
 
 
482 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  26.22 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2248  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0436  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0321608  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  23.11 
 
 
447 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0449  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2903  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1775  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0088  transposase InsC3 for insertion sequence ISEc9  24.8 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0568317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2289  transposase, IS4 family protein  23.39 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  23.05 
 
 
442 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1626  transposase, IS4  23.33 
 
 
447 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.982067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2424  transposase, IS4  23.33 
 
 
447 aa  47  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  21.36 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  21.36 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  21.36 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  21.36 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  21.36 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0476  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0296  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.600478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0873  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.446345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1331  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1930  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1994  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2637  transposase, IS4 family protein  22.66 
 
 
484 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.523228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  22.38 
 
 
307 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1221  transposase IS4 family protein  21.32 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  22.67 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>