55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0530 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3238  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
467 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3133  transposase, IS4 family protein  98.78 
 
 
467 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2628  transposase, IS4 family protein  98.78 
 
 
467 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1405  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
467 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1033  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
467 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0784  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
411 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0625  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
467 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0181  transposase, IS4 family protein  99.7 
 
 
467 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0311  transposase, IS4 family protein  99.09 
 
 
469 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0530  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
331 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0476  transposase IS4 family protein  47.69 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000219205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0301  transposase IS4 family protein  48.27 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0333  transposase IS4 family protein  48.27 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3275  transposase IS4 family protein  48.27 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1790  transposase IS4 family protein  47.69 
 
 
457 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000150796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1416  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1286  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1919  transposase IS4 family protein  48.27 
 
 
457 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00491229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0508  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3072  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3361  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0246  transposase IS4 family protein  47.98 
 
 
457 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000788871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1324  hypothetical protein  97.67 
 
 
190 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3053  transposase, IS4 family protein  43.77 
 
 
446 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177802  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0978  transposase, IS4 family protein  43.77 
 
 
446 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.057902  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2861  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0503  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0487  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0484  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3787  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0257  transposase IS4 family protein  42.01 
 
 
453 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  23.47 
 
 
465 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2144  hypothetical protein  23.47 
 
 
465 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.397175  normal  0.435128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2142  hypothetical protein  23.1 
 
 
465 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212429  normal  0.476953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0702  hypothetical protein  22.91 
 
 
443 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00422176  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2506  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.277466  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  22.91 
 
 
465 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1358  hypothetical protein  22.74 
 
 
465 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.250752  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1505  hypothetical protein  23.22 
 
 
465 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1857  hypothetical protein  23.22 
 
 
465 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000786395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  19.43 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  19.43 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  19.43 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2011  hypothetical protein  36 
 
 
183 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.271694  normal  0.217697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2533  hypothetical protein  24.14 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000022557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>