76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1414 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1414  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0328  rod shape-determining protein MreD  33.12 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0530008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  33.93 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2238  rod shape-determining protein MreD  36.36 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04260  rod shape-determining protein MreD  46.77 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0102  rod shape-determining protein MreD  38.55 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2726  rod shape-determining protein MreD  29.14 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0795555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  37.5 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3452  rod shape-determining protein MreD  41.94 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.973834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2493  rod shape-determining protein MreD  34.15 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.682687  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0513  rod shape-determining protein  37.21 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0975  rod shape-determining protein MreD  34.09 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1646  rod shape-determining protein MreD  37.21 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4280  rod shape-determining protein MreD  34.11 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  36.67 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3635  rod shape-determining protein MreD  36.25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148983  hitchhiker  0.00393044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3670  rod shape-determining protein MreD  36.25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.501294  normal  0.526814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3564  rod shape-determining protein MreD  36.25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  27.14 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3563  rod shape-determining protein MreD  36.25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.003884  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3732  rod shape-determining protein MreD  36.25 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  0.0778624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0935  rod shape-determining protein MreD  34.09 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0942  rod shape-determining protein MreD  34.09 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1939  rod shape-determining protein MreD  30.84 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0021147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  37.78 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0670  rod shape-determining protein  41.94 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0272534  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0262  hypothetical protein  36.78 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0589  rod shape-determining protein MreD  40.32 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.305731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0458  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0128703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3731  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000809472  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03108  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0458  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000615339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3544  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3280  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4565  rod shape-determining protein MreD  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00217188  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03059  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00130668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0502  rod shape-determining protein MreD  28.28 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0318  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0285  rod shape-determining protein MreD  29.85 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0356  rod shape-determining protein MreD  32.09 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  35.56 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3438  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0485  rod shape-determining protein MreD  31.34 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58120  rod shape-determining protein MreD  34.48 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3921  rod shape-determining protein MreD  40.38 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  33.75 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0840  rod shape-determining protein MreD  37.39 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  32.5 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  32.5 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3332  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.390226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5093  rod shape-determining protein MreD  38.89 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2493  rod shape-determining protein MreD  34.41 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.527003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1124  rod shape-determining protein MreD  43.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.974415  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0469  rod shape-determining protein MreD  26.13 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.795079  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0480  putative rod shape-determining protein MreD  31.34 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00540297  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0185  rod shape-determining protein MreD  30.95 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  34.92 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  34.92 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  27.54 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  37.84 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0081  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  35 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0858  rod shape-determining protein MreD  38.3 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.930455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3833  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6463  rod shape-determining protein MreD  25.77 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4096  rod shape-determining protein MreD  33.72 
 
 		 162 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0485  rod shape-determining protein MreD  28.04 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00628066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3646  rod shape-determining protein MreD  33.72 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.873858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0481  rod shape-determining protein MreD  33.72 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3470  rod shape-determining protein MreD  33.72 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168845  normal  0.899869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  28.92 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0576  rod shape-determining protein MreD  32.56 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3736  rod shape-determining protein MreD  30.95 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.284622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1125  rod shape-determining protein MreD  39.13 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.424224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>