26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2493 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2493  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 162 aa  304  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.682687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  50.68 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  51.35 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  51.35 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  41.83 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  40.74 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  41.22 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1414  rod shape-determining protein MreD  31.11 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  31.73 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  32.38 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  32.38 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  34.95 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3332  rod shape-determining protein MreD  37.88 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.390226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0935  rod shape-determining protein MreD  27.2 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0975  rod shape-determining protein MreD  27.2 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0942  rod shape-determining protein MreD  27.2 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  35.71 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  35.8 
 
 		 169 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4280  rod shape-determining protein MreD  27.2 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2726  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0795555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  38.18 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0102  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  35.71 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  31.31 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  29.13 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>