18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2546 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  100 
 
 		 164 aa  315  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2493  rod shape-determining protein MreD  51.35 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.682687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  44.2 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  42.21 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  44.76 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  45.99 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  29.27 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  33.78 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  30 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3332  rod shape-determining protein MreD  32.5 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.390226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  28.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  32.43 
 
 		 162 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3736  rod shape-determining protein MreD  30.12 
 
 		 163 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.284622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  31.08 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1414  rod shape-determining protein MreD  30.77 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>