13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2859 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  57.41 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  58.64 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  55.56 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  52.63 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2493  rod shape-determining protein MreD  41.83 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.682687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  42.21 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  25.52 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  29.1 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  26.27 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  27.94 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  26.23 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  32.31 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>