23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2461 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  97.5 
 
 		 160 aa  300  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  58.64 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  53.95 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  55.32 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2493  rod shape-determining protein MreD  51.35 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.682687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  44.2 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1414  rod shape-determining protein MreD  27.54 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  29.1 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  25.93 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  28.86 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  27.07 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  32.35 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  32.88 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0296  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  28.57 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  35.38 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1124  rod shape-determining protein MreD  39.29 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.974415  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  33.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  26.35 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  36.92 
 
 		 162 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>