30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3337 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 166 aa  320  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  49.09 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  36.13 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  31.06 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  35.77 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  35.21 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  28.14 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  34.25 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  34.96 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  27.61 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  27.66 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2373  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  43.21 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  31.39 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  27.66 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  29.91 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  42.25 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  28.28 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  31.17 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1822  rod shape-determining protein MreD  30.09 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2108  rod shape-determining protein MreD  35.48 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2396  rod shape-determining protein MreD  35.48 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  48.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  30.51 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1259  rod shape-determining protein MreD  27.04 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00973114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  26.4 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  25.6 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>