31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1639 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  37.2 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  36.3 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  34.23 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2396  rod shape-determining protein MreD  27.81 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2108  rod shape-determining protein MreD  27.81 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  30.47 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  29.41 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  29.32 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  29.87 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1822  rod shape-determining protein MreD  28.95 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  44.44 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  27.21 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  27.13 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  45.76 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  31.87 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  25.52 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  24.14 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  31.96 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  28.78 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  23.97 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  46.3 
 
 		 178 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3365  rod shape-determining protein MreD  27.55 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0328  rod shape-determining protein MreD  26.74 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0530008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3688  rod shape-determining protein MreD  31.34 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  26.67 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>