25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2561 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 170 aa  327  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  40.83 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  35.34 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  26.22 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  32.56 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  38.95 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  27.89 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  30.56 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  26.79 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  29.85 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  26.58 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  33.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  29.3 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  29.1 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  29.05 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  28.28 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  29.51 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  34.67 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  36.49 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  32.86 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>