12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3389 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 179 aa  357  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4128  rod shape-determining protein MreD  62.73 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4168  rod shape-determining protein MreD  62.73 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0147554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0868  rod shape-determining protein MreD  52.27 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000649677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  52.81 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  51.69 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1152  hypothetical protein  51.77 
 
 		 198 aa  174  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450592  hitchhiker  0.00560456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0298  hypothetical protein  26.13 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17461  hypothetical protein  20.17 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01811  hypothetical protein  26.15 
 
 		 169 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0151  hypothetical protein  22.58 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1713  hypothetical protein  30.85 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>