15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1152 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1152  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450592  hitchhiker  0.00560456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0868  rod shape-determining protein MreD  51.16 
 
 
211 aa  185  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000649677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4128  rod shape-determining protein MreD  53.12 
 
 
181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4168  rod shape-determining protein MreD  53.12 
 
 
181 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0147554  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  49.7 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  56.25 
 
 
200 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  47.53 
 
 
179 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0298  hypothetical protein  28.79 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0151  hypothetical protein  25.29 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17461  hypothetical protein  25.62 
 
 
168 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01811  hypothetical protein  27.43 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18301  hypothetical protein  48.21 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18121  hypothetical protein  45.45 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546148  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18091  hypothetical protein  25.58 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1713  hypothetical protein  29.58 
 
 
172 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>