17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0151 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0151  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  331  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01811  hypothetical protein  64.24 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0107  hypothetical protein  77.65 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.712193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17461  hypothetical protein  43.98 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20721  hypothetical protein  28.31 
 
 
167 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1197  hypothetical protein  32.19 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18301  hypothetical protein  36.91 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1713  hypothetical protein  34.93 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18091  hypothetical protein  37.69 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18121  hypothetical protein  34.81 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  29.69 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1152  hypothetical protein  26.28 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.450592  hitchhiker  0.00560456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  25.37 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4128  rod shape-determining protein MreD  30.77 
 
 
181 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4168  rod shape-determining protein MreD  29.63 
 
 
181 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0147554  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0298  hypothetical protein  43.06 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3389  rod shape-determining protein MreD  22.58 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0375737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>