142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0424 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



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Plasmid clonability

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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0424  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0411  CutA1 divalent ion tolerance protein  91.35 
 
 
104 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1508  CutA1 divalent ion tolerance protein  87.5 
 
 
104 aa  192  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  71.72 
 
 
107 aa  160  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.227218  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.58 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0318  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.344842  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  36.54 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1695  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.158943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.62 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1752  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.14 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.65 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.04 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.65 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  33.33 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.57 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.79 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0828  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.69 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.25 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.29 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  31 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  28 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  26 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  31 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  24 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.72 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  32.89 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.28 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.96 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  25 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.3 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.87 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.57 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.53 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  30 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.88 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.03 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.16 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.18 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  27 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  24.49 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.53 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.29 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1688  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.31 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  26.67 
 
 
125 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.28 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.37 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  26 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  26 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  23.81 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.47 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  23.81 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  25.96 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3287  periplasmic divalent cation tolerance protein  22.92 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.37 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  31 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.29 
 
 
104 aa  48.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.51 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05621  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.72 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.434314  normal  0.515801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  28 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.26 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.72 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1837  hypothetical protein  28.72 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.8 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.49 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.3 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  25.25 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.53 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  27 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  24.47 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  23 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1513  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.71 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  24.24 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1306  CutA1 divalent ion tolerance protein  29 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  27 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  23 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  23.16 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3509  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.43 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.666044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  21.43 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
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NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  23.16 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.24 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  23 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  23 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  24 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  23.23 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  26.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  26.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  26.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  26.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  26.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
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NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.25 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  25 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  22 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  22 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
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NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  26.92 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
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