193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0605 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
112 aa  233  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  55.34 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.98 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  45.87 
 
 
125 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.6 
 
 
107 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 
107 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 
107 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 
107 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 
107 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 
107 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 
107 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  44.66 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 
116 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  43.43 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.34 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.26 
 
 
114 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
126 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.74 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.32 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
107 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.91 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  44 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.22 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.54 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.05 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0711  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.68 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.604459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.91 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.62 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.45 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.46 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  38.61 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.89 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.91 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  37 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.95 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.49 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.49 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.38 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.35 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  36.89 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  37.62 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.49 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  37.62 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  37.62 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  37.62 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.49 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  41.49 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  41.49 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.49 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  37.62 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  33.33 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.1 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.62 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  34.29 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  34.69 
 
 
580 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.43 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.08 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
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NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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