193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2991 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  85.59 
 
 		 112 aa  189  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  79.46 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  60 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  55.77 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  55.34 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  52.94 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  60.78 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  59 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.11 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  48.54 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.73 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.46 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.12 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  47 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.93 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.24 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  43.14 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.68 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  42.42 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.51 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  39.22 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  41.51 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  43.75 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  41.07 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.19 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.37 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  43.27 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.74 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  35.35 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.41 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.23 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.67 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.2 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  34.65 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.38 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.89 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.74 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.45 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.26 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  34.65 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  34.65 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  34.65 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  35.29 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.32 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.75 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.72 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.19 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  42.39 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.75 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  41.75 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  41.75 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.75 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>