193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3827 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  100 
 
 
119 aa  243  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  100 
 
 
119 aa  243  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  100 
 
 
119 aa  243  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  80.19 
 
 
107 aa  179  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  76.42 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  76.42 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  76.42 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  76.42 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  76.42 
 
 
115 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  76.19 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  79.41 
 
 
107 aa  170  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  73.79 
 
 
126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  75.49 
 
 
110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  73.53 
 
 
110 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  72.55 
 
 
110 aa  157  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.33 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.42 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.75 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  43.43 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.3 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  36.36 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.68 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.84 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.42 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  37 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.27 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
102 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  38.54 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.95 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2619  putative divalent-cation tolerance protein  40.86 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0176718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.39 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.87 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  42.27 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  36 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.25 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.65 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  29 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.95 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2717  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.583537  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.44 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.44 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  44.44 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  44.44 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.44 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.07 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.44 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.44 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
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NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  36.46 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
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NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.27 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
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NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
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NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.07 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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