189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3616 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
110 aa  222  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  91.51 
 
 
106 aa  199  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  72.73 
 
 
110 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  72.64 
 
 
116 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  72.64 
 
 
116 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  72.64 
 
 
116 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  72.64 
 
 
116 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  72.64 
 
 
116 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  72.64 
 
 
108 aa  167  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  72.64 
 
 
108 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  70.75 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  68.87 
 
 
108 aa  156  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  68.87 
 
 
108 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  72.64 
 
 
108 aa  146  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0376  CutA1 divalent ion tolerance protein  69.81 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0355  CutA1 divalent ion tolerance protein  70.75 
 
 
108 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0295  CutA1 divalent ion tolerance protein  69.81 
 
 
108 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2731  CutA1 divalent ion tolerance protein  68.87 
 
 
107 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.86 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  47.96 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.52 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.08 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  43 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  43 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  43 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  43.27 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  43.88 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  40.78 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  47 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  47.52 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.18 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  38.83 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2717  CutA1 divalent ion tolerance protein  51.28 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.583537  normal  0.620046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  40.78 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  37.86 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.38 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  46.39 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.71 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.35 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.35 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  38.83 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.19 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.46 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  40.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.74 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.1 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.99 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.14 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  39 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.02 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  40 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 
127 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  35 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.64 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.01 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.29 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.14 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.34 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
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NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  35.96 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007335  PMN2A_1837  hypothetical protein  30.61 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.66 
 
 
106 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
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