193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0539 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  100 
 
 
110 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
107 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.51 
 
 
107 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.98 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.98 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  51.46 
 
 
107 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.51 
 
 
107 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.51 
 
 
107 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.02 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  50.98 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.08 
 
 
107 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.69 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
115 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.04 
 
 
107 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.57 
 
 
121 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
113 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 
105 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  47 
 
 
102 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.5 
 
 
115 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.82 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 
109 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.19 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.25 
 
 
126 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.35 
 
 
124 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.05 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.46 
 
 
124 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  44.44 
 
 
103 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  45.45 
 
 
107 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  41.51 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.53 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.71 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.51 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.83 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 
107 aa  84.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  39.22 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  44 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.81 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.19 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.81 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000176  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA  40.59 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.444821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.14 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  37.61 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.81 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  44 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.83 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  42 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.68 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4654  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.664521  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  38.61 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.11 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  38 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  37 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.58 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.62 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2095  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.02 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.46 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  41.18 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.64 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  40 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  37.25 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3226  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508585  normal  0.268666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  35.58 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.62 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  34.34 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  33.33 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  32.99 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.98 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>