192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0040 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 107 aa  218  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  85.71 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.04 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  53 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  41.41 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.36 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  42.86 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.54 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  43.81 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.36 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0080  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.19 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1306  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.45 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.51 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
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NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.16 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
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NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.92 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1695  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.158943  n/a   
 
 
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NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  37.37 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.57 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1513  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.37 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_3194  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.02 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.19 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
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NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
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NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1752  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
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NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  46 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  40.2 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
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NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
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NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.86 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  35.87 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.94 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.65 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1688  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3226  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508585  normal  0.268666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.65 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.29 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  40.43 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  37.14 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  37 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.24 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  36.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  36.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.19 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.71 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.96 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  37.36 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.29 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.32 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.58 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.54 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000176  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA  37.11 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.444821  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  40 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  35.24 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
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NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.55 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal  1 
 
 
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