187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03922 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2603  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3748  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3141  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
116 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1952  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
116 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3718  divalent cation tolerance family protein  44.23 
 
 
116 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3776  divalent cation tolerance family protein  44.23 
 
 
116 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.930326  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3506  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
116 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.9 
 
 
112 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 
113 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3040  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.994008  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.32 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0342  periplasmic cytochrome biogenesis protein  43.75 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  41 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3616  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00421644  hitchhiker  0.000000032142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.68 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.79 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
110 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.6 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  39 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  43.56 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3475  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 
108 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  42.42 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  42.42 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  42.42 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0304  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0432895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1669  putative divalent cation tolerance protein  42.27 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  41.58 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  40.4 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  40 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0277  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
126 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.83 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  38.83 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0689  putative divalent cation tolerance protein  43.01 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  38 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  38.38 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.25 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0318  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.69 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.344842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0295  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  42.31 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0355  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.37 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.5 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.68 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0376  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.38 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0244  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00963425  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1082  threonine synthase  38.78 
 
 
580 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000183977  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.21 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.11 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  41.41 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  35.71 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.3 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2731  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.42 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.91 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.23 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1837  hypothetical protein  34.69 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05621  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.69 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.434314  normal  0.515801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.68 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  40 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.59 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
102 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.21 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.33 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.71 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.89 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.27 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3287  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.57 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  39 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>