190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0548 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  97.2 
 
 		 107 aa  209  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0519  CutA1 divalent ion tolerance protein  91.43 
 
 		 107 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0812329  normal  0.323933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  80 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  78.85 
 
 		 117 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  74.29 
 
 		 106 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  50.5 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  40.78 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  42.27 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.81 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.81 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  39.81 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.57 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  34.31 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0716  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.06 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.737655  normal  0.575155 
 
 
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NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
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NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.57 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
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NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.54 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  41.41 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  45 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  42.71 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.31 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
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NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  39.58 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2619  putative divalent-cation tolerance protein  43.69 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0176718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  39.58 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  39.6 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  41.67 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.925297 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  40.62 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742886 
 
 
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NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.78 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  38 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.24 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0828  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.36 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
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NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.2 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  36.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  38.38 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  36.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  36.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.14 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
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NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.62 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.95 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1695  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.158943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0665  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.8 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2922  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198064 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  32.08 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1752  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.13 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0318  CutA1 divalent ion tolerance protein  32 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.344842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  32.99 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.38 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1621  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.178296  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1690  periplasmic divalent cation tolerance protein  37.76 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0635803  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03922  periplasmic divalent cation tolerance protein  42.68 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  32 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  36 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.227218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  41 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.63 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.39 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.83 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.89 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_3287  periplasmic divalent cation tolerance protein  35 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.42 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.496256 
 
 
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NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.31 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  35 
 
 		 107 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
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NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.66 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
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NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
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