195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2000 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 127 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  56.52 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  55.34 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  54.37 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  50 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.47 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0828  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.54 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.48 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0333  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.98 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241952  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  46.46 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.46 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  48.94 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.88 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  54.88 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4166  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.19 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  41.18 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.21 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  45.92 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.66 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  44.23 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  44.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  46 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.57 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0199  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.69 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  40.57 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.42 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.46 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.49 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.49 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.75 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.16 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  45.54 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.44 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.72 
 
 		 105 aa  87.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  40.82 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  43.27 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  36.17 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  40.95 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  40.95 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.43 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.35 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  48.15 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  40.95 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  40.95 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  40.95 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2702  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.41 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  39.62 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6084  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.42 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.79 
 
 		 121 aa  84.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.82 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1306  CutA1 divalent ion tolerance protein  45 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.09 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.11 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0548  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.54 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.78 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  39.42 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  42 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.55 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.75 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  37.96 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  39.8 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3509  CutA1 divalent ion tolerance protein  47.42 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.666044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2095  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.42 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5027  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.15 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.739286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.31 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.45 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
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NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  36.08 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3629  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302661  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  36.75 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1133  CutA1 divalent ion tolerance protein  49.49 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.81 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_0483  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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