192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4624 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 
116 aa  240  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.55 
 
 
111 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  41.51 
 
 
125 aa  94  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.86 
 
 
112 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.08 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  42 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00920  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  46.15 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.21 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  42.71 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000176  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA  39.8 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.444821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.16 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3135  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.12 
 
 
129 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00931834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0417  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.67 
 
 
107 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000143312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3199  CutA1 divalent ion tolerance protein  37 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3246  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.22 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  41 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0286  CutA1 divalent ion tolerance protein  46.32 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.560656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3298  CutA1 divalent ion tolerance protein  43 
 
 
106 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07401  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.76 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0584  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.759939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  45.63 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0697  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  37.25 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2095  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.86 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  42.16 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.27 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3827  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.625721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0727  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.61 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3680  divalent-cation tolerance protein CutA  38.78 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1040  periplasmic divalent cation tolerance protein, putative  41.41 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9065  hypothetical protein  41.49 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1797  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.05 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.33 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.67 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.43 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.16 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04007  copper binding protein, copper sensitivity  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3855  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5653  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000216673  normal  0.759163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03969  hypothetical protein  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4606  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00265756  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3875  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4378  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.043112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4692  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0404  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607998  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4666  divalent-cation tolerance protein CutA  36.27 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.18 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4720  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0186554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.78 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3665  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0560029  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1044  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.65 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.402781  hitchhiker  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4602  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.811506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1912  CutA1 divalent ion tolerance protein  41.24 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4685  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4742  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4594  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.925297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3265  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.73 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189693  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2811  CutA1 divalent ion tolerance protein  43.56 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.434183 
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  32.67 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3409  divalent-cation tolerance protein CutA  36.73 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3226  CutA1 divalent ion tolerance protein  34 
 
 
172 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508585  normal  0.268666 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0785  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.65 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.63 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.66 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  44.55 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  40 
 
 
105 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.18 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.43 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  34.69 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1598  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.62 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  32.67 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2684  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.29 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.11 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0504  divalent-cation tolerance protein CutA  34.62 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0324  divalent-cation tolerance protein CutA  34.69 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2175  CutA1 divalent ion tolerance protein  40.4 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05051  CutA1 divalent ion tolerance protein  29 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0443874  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0723  divalent-cation tolerance protein CutA  35.58 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2560  divalent cation tolerance protein  41.58 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0011  CutA1 divalent ion tolerance protein  33 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0539  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  35.51 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00953533  decreased coverage  0.00314697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.68 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.69 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1750  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.89 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.84 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4157  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.99 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.496256 
 
 
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NC_007777  Francci3_1378  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.76 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.897354  normal  0.0284083 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  39 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
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