More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5574 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5574  regulatory protein  100 
 
 
69 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  82.54 
 
 
450 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.38 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.74 
 
 
448 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  49.21 
 
 
450 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.32 
 
 
452 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.67 
 
 
452 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.72 
 
 
448 aa  63.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  50 
 
 
452 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45 
 
 
449 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  55.1 
 
 
455 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  45.16 
 
 
451 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  45.16 
 
 
451 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.67 
 
 
456 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  45.16 
 
 
451 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  45.16 
 
 
451 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  50.79 
 
 
443 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  45.16 
 
 
451 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  45.16 
 
 
452 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  45.16 
 
 
452 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  46.77 
 
 
451 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  49.12 
 
 
458 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  45.16 
 
 
452 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45 
 
 
449 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  43.55 
 
 
451 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.91 
 
 
459 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  52.83 
 
 
448 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  50.94 
 
 
461 aa  57  0.00000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  49.06 
 
 
446 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  45.61 
 
 
447 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.1 
 
 
457 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  49.12 
 
 
451 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  53.7 
 
 
459 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
479 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
479 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
479 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  45.61 
 
 
453 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  47.27 
 
 
464 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.91 
 
 
453 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  41.27 
 
 
450 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
479 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  45.16 
 
 
448 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  46.15 
 
 
461 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  50.88 
 
 
452 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  48.98 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
480 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
480 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.9 
 
 
466 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  44.83 
 
 
584 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
450 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.97 
 
 
479 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
473 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  43.1 
 
 
496 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  50.94 
 
 
452 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  50 
 
 
461 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
481 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  50.94 
 
 
451 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
462 aa  53.9  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  49.12 
 
 
466 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  49.06 
 
 
449 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.06 
 
 
480 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  40.32 
 
 
456 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  48.15 
 
 
459 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  47.17 
 
 
450 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  47.17 
 
 
450 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  47.17 
 
 
451 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.1 
 
 
489 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
473 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
461 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  43.55 
 
 
451 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
585 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 
463 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  46.43 
 
 
470 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.02 
 
 
480 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  54.17 
 
 
474 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  50 
 
 
767 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  50 
 
 
460 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>