More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1621 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1621  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1597  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  96.99 
 
 
332 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1903  alcohol dehydrogenase  60.96 
 
 
335 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4458  alcohol dehydrogenase  61.56 
 
 
332 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.47566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.36 
 
 
588 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.81 
 
 
331 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.49 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.39 
 
 
331 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.57 
 
 
327 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  48.47 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  48.16 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.27 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  48.16 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  48.16 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  48.16 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
327 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.85 
 
 
328 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.59 
 
 
328 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  48.16 
 
 
327 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  46.01 
 
 
324 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  46.32 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.32 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  46.32 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  46.32 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  46.32 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  46.01 
 
 
324 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  46.01 
 
 
324 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  46.01 
 
 
324 aa  275  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.65 
 
 
329 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
345 aa  275  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
326 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.04 
 
 
336 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.09 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
327 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.81 
 
 
328 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  44.24 
 
 
328 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.43 
 
 
332 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.38 
 
 
330 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.71 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  45.45 
 
 
328 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
326 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  43.87 
 
 
327 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
326 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.12 
 
 
326 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.81 
 
 
329 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  46.34 
 
 
330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
334 aa  268  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.27 
 
 
331 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  47.55 
 
 
327 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.12 
 
 
332 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.65 
 
 
328 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
328 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.18 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.71 
 
 
327 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.16 
 
 
327 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 
326 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
326 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.43 
 
 
325 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.73 
 
 
325 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.26 
 
 
325 aa  265  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.48 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 
326 aa  265  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.43 
 
 
330 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.04 
 
 
336 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
327 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.43 
 
 
329 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 
327 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.55 
 
 
332 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
328 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.41 
 
 
331 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  44.24 
 
 
330 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.73 
 
 
336 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
328 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  44.24 
 
 
330 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
326 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.71 
 
 
327 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  45.92 
 
 
328 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.94 
 
 
328 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
326 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.94 
 
 
333 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  45.26 
 
 
326 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  46.63 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  45.62 
 
 
332 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.01 
 
 
327 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.56 
 
 
327 aa  258  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  45.59 
 
 
328 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.95 
 
 
326 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  43.12 
 
 
327 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  45.59 
 
 
329 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
334 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 
334 aa  257  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.71 
 
 
325 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.01 
 
 
327 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>