214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4641 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  95.24 
 
 		 317 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  95.24 
 
 		 317 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 375 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5429  hypothetical protein  92.06 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.308661 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5604  hypothetical protein  92.06 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.689274  normal  0.6989 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5826  hypothetical protein  92.06 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.27986 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6005  hypothetical protein  92.06 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000975175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  72.58 
 
 		 317 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  38.04 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  38.04 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  38.04 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  36.96 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 308 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  47.54 
 
 		 278 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  47.54 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  37.07 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  44 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  44 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  44 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  44 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  45.9 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  38.96 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  38.96 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  41.33 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  41.33 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  41.79 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  41.79 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  41.79 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  41.79 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  41.79 
 
 		 285 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  40.54 
 
 		 283 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  44.78 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  40.3 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  48.28 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  38.96 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  38.96 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  34.12 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  45.31 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  45.31 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  45.31 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>